Hoàn thuế GTGT dự án đầu tư: 2 trường hợp bị từ chối từ 01/7/2025

Chúng tôi lưu ý khách hàng về quy định mới tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 (số 48/2024/QH15), có hiệu lực từ 01/7/2025, theo đó có 02 trường hợp dự án đầu tư không được hoàn thuế GTGT mà phải kết chuyển số thuế chưa khấu trừ sang kỳ tiếp theo.

Khi nào dự án đầu tư được hoàn thuế GTGT?

Theo điểm a khoản 2 Điều 15 Luật Thuế GTGT 2024, cơ sở kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới hoặc mở rộng đang trong giai đoạn đầu tư sẽ được xem xét hoàn thuế nếu sau khi bù trừ với số thuế phải nộp của hoạt động đang thực hiện, số thuế GTGT đầu vào còn chưa khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên.

2 trường hợp bị từ chối hoàn thuế là gì?

Điểm b khoản 2 Điều 15 Luật Thuế GTGT 2024 quy định cụ thể 02 trường hợp sau:

• Chưa góp đủ vốn điều lệ: Tại thời điểm nộp hồ sơ hoàn thuế, doanh nghiệp chưa góp đủ số vốn điều lệ đã đăng ký. Quy định này cũng áp dụng khi kinh doanh ngành, nghề có điều kiện nhưng chưa đáp ứng hoặc không duy trì đủ điều kiện kinh doanh. Ngoại lệ: dự án đang trong giai đoạn đầu tư chưa phải xin giấy phép kinh doanh ngành nghề có điều kiện theo quy định.
• Khai thác tài nguyên, khoáng sản: Dự án khai thác tài nguyên, khoáng sản không được hoàn thuế, trừ dự án tìm kiếm, thăm dò, phát triển mỏ dầu khí. Bên cạnh đó, dự án sản xuất sản phẩm từ tài nguyên, khoáng sản khai thác đã chế biến thành sản phẩm khác (theo khoản 23 Điều 5 Luật Thuế GTGT 2024) cũng bị loại trừ hoàn thuế.

Đáng chú ý, việc không được hoàn thuế không làm mất số thuế GTGT đầu vào. Theo quy định, số thuế chưa khấu trừ sẽ được kết chuyển sang kỳ tiếp theo để tiếp tục xử lý.

Theo đánh giá của các chuyên gia pháp lý, quy định mới nhằm siết chặt việc hoàn thuế đối với các dự án chưa hoàn tất nghĩa vụ pháp lý về vốn hoặc có rủi ro thất thu ngân sách từ tài nguyên khoáng sản.

Khách hàng cần làm gì?

Trước khi lập hồ sơ hoàn thuế GTGT, doanh nghiệp cần rà soát kỹ 3 vấn đề: (1) tình trạng góp vốn điều lệ so với đăng ký, (2) đáp ứng đủ điều kiện kinh doanh ngành nghề, (3) lĩnh vực đầu tư có thuộc diện khai thác khoáng sản. Việc xác định chính xác sẽ giúp doanh nghiệp tránh bị từ chối hồ sơ và chủ động phương án kết chuyển thuế. Chúng tôi khuyến nghị liên hệ luật sư tư vấn thuế để được hỗ trợ chi tiết theo từng dự án cụ thể.