Hướng dẫn chi tiết nâng cấp phần mềm HTKK 5.6.6: Những thay đổi thuế xăng dầu bạn cần biết

Ngày 17/4/2026, Cục Thuế đã chính thức phát hành phiên bản nâng cấp phần mềm Hỗ trợ kê khai (HTKK) 5.6.6 nhằm đáp ứng các quy định mới về thuế đối với xăng, dầu và nhiên liệu bay theo Nghị quyết số 19/2026/QH16. Đây là bản cập nhật quan trọng mà mọi doanh nghiệp kinh doanh xăng dầu, nhiên liệu bay cần nắm rõ để tránh sai sót khi kê khai thuế. Trong bài viết này, chúng tôi sẽ phân tích chi tiết từng nội dung nâng cấp, giúp bạn kịp thời áp dụng và tuân thủ đúng quy định pháp luật.

Phần mềm HTKK 5.6.6 thay đổi gì về thuế bảo vệ môi trường?

Theo Công điện số 09/CĐ-CT do Cục Thuế ban hành, phiên bản HTKK 5.6.6 đã cập nhật danh mục mã thuế bảo vệ môi trường với mức thuế suất 0 đồng/lít cho các mặt hàng sau:

• Mã 020201: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng xăng (trừ etanol) bán ra trong nước
• Mã 020202: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng dầu diezel bán ra trong nước
• Mã 020203: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng dầu hỏa bán ra trong nước
• Mã 020205: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng nhiên liệu bay bán ra trong nước
• Mã 020206: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng xăng E5 RON92 (trừ etanol) bán ra trong nước
• Mã 020207: Thuế bảo vệ môi trường mặt hàng dầu mazut bán ra trong nước

Đáng chú ý, Nghị quyết số 19/2026/QH16 do Quốc hội thông qua ngày 12/4/2026 có hiệu lực thi hành từ ngày 16/4/2026 và kéo dài đến hết ngày 30/6/2026. Trong thời gian này, doanh nghiệp sẽ không phải nộp thuế bảo vệ môi trường đối với các mặt hàng trên. Tuy nhiên, sau ngày 30/6/2026, mức thuế sẽ trở lại như quy định cũ, do đó bạn cần theo dõi sát sao để cập nhật kịp thời.

Theo đánh giá của các chuyên gia pháp lý, việc giảm thuế bảo vệ môi trường về 0 đồng/lít là biện pháp kích thích kinh tế, giúp giảm giá xăng dầu đầu vào cho doanh nghiệp và người tiêu dùng. Tuy nhiên, doanh nghiệp cần lưu ý thời hạn áp dụng có hạn, tránh nhầm lẫn khi lập tờ khai sau ngày 30/6/2026.

Thuế GTGT đối với xăng dầu thay đổi thế nào trong HTKK 5.6.6?

Một trong những thay đổi quan trọng nhất mà phần mềm HTKK 5.6.6 mang lại là việc cập nhật chính sách thuế GTGT đối với mặt hàng xăng dầu. Cụ thể:

• Không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT: Doanh nghiệp kinh doanh xăng, dầu diezel, dầu hỏa, dầu mazut và nhiên liệu bay không cần phải kê khai và nộp thuế GTGT đầu ra cho các mặt hàng này.
• Vẫn được khấu trừ thuế GTGT đầu vào: Mặc dù không phải nộp thuế đầu ra, doanh nghiệp vẫn được khấu trừ toàn bộ thuế GTGT đầu vào liên quan đến hoạt động kinh doanh xăng dầu.

Điều này đồng nghĩa với việc doanh nghiệp sẽ không phải ghi nhận doanh thu chịu thuế GTGT đối với các mặt hàng này trên tờ khai, nhưng vẫn được hưởng lợi từ việc khấu trừ thuế đầu vào. Theo chúng tôi, đây là một chính sách ưu đãi đặc biệt, đòi hỏi kế toán doanh nghiệp phải cập nhật ngay để tránh kê khai sai dẫn đến bị xử phạt.

Tình huống thực tế

Công ty TNHH Xăng dầu ABC (Hà Nội) kinh doanh xăng E5 RON92 và dầu diezel. Trong tháng 4/2026, công ty nhập khẩu 100.000 lít xăng E5 với giá chưa thuế GTGT là 20 tỷ đồng, thuế GTGT đầu vào là 2 tỷ đồng. Theo quy định mới, khi bán ra, công ty không phải kê khai thuế GTGT đầu ra nhưng vẫn được khấu trừ toàn bộ 2 tỷ đồng thuế GTGT đầu vào. Nếu không cập nhật HTKK 5.6.6, công ty có thể kê khai sai dẫn đến bị truy thu và phạt tiền từ 10-20 triệu đồng theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

Thuế suất thuế tiêu thụ đặc biệt đối với xăng trong HTKK 5.6.6 là bao nhiêu?

Phiên bản HTKK 5.6.6 đã nâng cấp danh mục thuế tiêu thụ đặc biệt với các mã mới cho xăng và nhiên liệu bay, cụ thể:

• Mã 1050101: Xăng (0%)
• Mã 1050201: Xăng E5 (0%)
• Mã 1050301: Xăng E10 (0%)
• Mã 1050401: Xăng nhập khẩu bán ra trong nước (0%)
• Mã 1050501: Xăng E5 nhập khẩu bán ra trong nước (0%)
• Mã 1050601: Xăng E10 nhập khẩu bán ra trong nước (0%)

Việc áp dụng thuế suất 0% đồng nghĩa với việc doanh nghiệp không phải tính và nộp thuế TTĐB đối với xăng trong giai đoạn này. Tuy nhiên, hãy lưu ý rằng đây chỉ là chính sách tạm thời, có hiệu lực đến hết ngày 30/6/2026. Sau thời điểm này, thuế suất TTĐB sẽ trở lại mức cũ, và doanh nghiệp cần cập nhật phiên bản mới nhất của HTKK để kê khai chính xác.

Theo đánh giá của các chuyên gia pháp lý, việc giảm thuế TTĐB về 0% là một phần trong gói kích thích kinh tế của Chính phủ nhằm giảm áp lực lạm phát. Tuy nhiên, doanh nghiệp cần theo dõi chặt chẽ thời hạn áp dụng để tránh vi phạm pháp luật về thuế.

Những nâng cấp khác trong HTKK 5.6.6 mà doanh nghiệp cần biết

Nâng cấp tờ khai quyết toán thuế TNDN (03/TNDN)

Tại phụ lục 03-3A của tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp, HTKK 5.6.6 đã bổ sung tính năng cảnh báo khi người nộp thuế chọn sai đối tượng ưu đãi. Cụ thể, nếu tích vào nút “Dự án đầu tư – kinh doanh nhà ở xã hội”, ứng dụng chỉ cho phép chọn một lựa chọn duy nhất: “Đầu tư xây dựng nhà ở xã hội để bán, cho thuê, cho thuê mua đối với các đối tượng được hưởng chính sách hỗ trợ về nhà ở xã hội theo quy định của Luật Nhà ở”. Nếu chọn sai, hệ thống sẽ hiển thị cảnh báo đỏ, giúp doanh nghiệp tránh sai sót khi kê khai.

Nâng cấp tờ khai thuế tạm tính đối với dầu khí (01/TK-DK)

Phiên bản HTKK 5.6.6 cập nhật mẫu in tờ khai với thông tin “Ban hành theo Nghị định số 373/2025/NĐ-CP ngày 31 tháng 12 năm 2025 của Chính phủ”. Điều này giúp đảm bảo tính hợp pháp và thống nhất của tờ khai khi nộp cho cơ quan thuế.

Nâng cấp bộ báo cáo tài chính theo Thông tư 125/2011/TT-BTC

Tại phụ lục LCTTGT (báo cáo lưu chuyển tiền tệ), mã chỉ tiêu 08 được cập nhật tự động tính theo công thức: 08 = 01 + 02 + 03 + 04 + 05 + 06. Người dùng không được phép sửa công thức này, đảm bảo tính chính xác của báo cáo tài chính.

Lời khuyên từ luật sư

Dựa trên những thay đổi quan trọng trong phần mềm HTKK 5.6.6, chúng tôi khuyến nghị quý khách hàng thực hiện các bước sau để đảm bảo tuân thủ pháp luật và tránh rủi ro:

1. Cập nhật ngay phần mềm HTKK 5.6.6: Tải về từ trang chủ của Cục Thuế (https://www.gdt.gov.vn) hoặc cổng thông tin điện tử của cơ quan thuế địa phương. Việc sử dụng phiên bản cũ có thể dẫn đến kê khai sai, bị xử phạt theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP với mức phạt từ 5-50 triệu đồng tùy mức độ vi phạm.
2. Rà soát lại toàn bộ tờ khai thuế GTGT, TTĐB và bảo vệ môi trường: Đảm bảo áp dụng đúng mức thuế suất 0% và mã số thuế mới theo danh mục của HTKK 5.6.6.
3. Theo dõi thời hạn áp dụng Nghị quyết 19/2026/QH16: Chính sách chỉ có hiệu lực từ 16/4/2026 đến 30/6/2026. Sau ngày 30/6/2026, doanh nghiệp cần quay lại kê khai theo mức thuế cũ.
4. Kiểm tra tính năng cảnh báo trên tờ khai 03/TNDN: Nếu doanh nghiệp đầu tư nhà ở xã hội, hãy chắc chắn chọn đúng đối tượng ưu đãi để tránh bị từ chối hoặc truy thu thuế.
5. Lưu trữ đầy đủ chứng từ: Để được khấu trừ thuế GTGT đầu vào, doanh nghiệp cần có hóa đơn, chứng từ hợp pháp theo quy định tại Thông tư 78/2014/TT-BTC và các văn bản sửa đổi.

Câu hỏi thường gặp